《清华大学学报（自然科学版）》是由中华人民共和国教育部主管、清华大学主办的学术期刊，由清华大学出版社出版。
1915年，《清华大学学报（自然科学版）》创刊，原名《清华月刊》。1915年12月，更名为《清华学报》。1955年，更名为《清华大学学报》。1974年10月，与《北京大学学报》合刊为《清华北大理工学报》。1986年，《清华大学学报》理工类学报相应更名为《清华大学学报（自然科学版）》。
据2018年9月《清华大学学报（自然科学版）》编辑部官网显示，《清华大学学报（自然科学版）》执行委员会有委员16人；特约编委4人。据2018年9月23日中国知网显示，《清华大学学报（自然科学版）》出版文献量11176篇，总被下载量2786829次，总被引量144138次，2017版复合影响因子0.833、综合影响因子0.541。据2018年9月23日万方数据知识服务平台显示，《清华大学学报（自然科学版）》载文量为4569篇，被引量为82674次，下载量为419668次。
栏目方向
《清华大学学报（自然科学版）》开设研究动态、信息科学、机械工程、精密仪器与机械学、工程力学、汽车工程、水利与水电工程、核能技术等栏目。
收录情况
《清华大学学报（自然科学版）》被CA美国化学文摘（2014）、CSCD中国科学引文数据库来源期刊（含扩展版）（2015-2016年度）、EI美国工程索引（2014）、JST日本科学技术振兴机构数据库（2013）、Pж（AJ）俄罗斯文摘杂志、SA英国科学文摘（2011）、万方、上海图书馆馆藏、剑桥科学文摘、北大核心期刊、国家图书馆馆藏、文摘与引文数据库、知网、统计源核心期刊、维普等中国国内外文献检索机构收录。
出版发行
据2018年9月23日中国知网显示，《清华大学学报（自然科学版）》出版文献量11176篇 。
据2018年9月23日万方数据知识服务平台显示，《清华大学学报（自然科学版）》载文量为4569篇。
影响因子
据2018年9月23日中国知网显示，《清华大学学报（自然科学版）》总下载量2786829次，总被引量144138次，2017版复合影响因子0.833、综合影响因子0.541。
据2018年9月23日万方数据知识服务平台显示，《清华大学学报（自然科学版）》被引量为82674次，下载量为419668次；据2015年中国期刊引证报告（扩刊版）数据显示，2015年影响因子为0.59，在全部统计源期刊（6735种）中排第2405名，在大学学报（自然科学）（269种）中排第47名。
荣誉表彰
1999年，在建国50年评优活动中获“首届国家期刊奖”。
2001年，以“双高”期刊进入“中国期刊方阵”。
2002年，获得“第二届国家期刊奖”。
2003年，获得“百种中国杰出学术期刊”称号。
2005年，获得“第三届国家期刊奖提名奖”。
2011年，在工程与技术类大学学报中的综合评价总分排名第一，获得“中国百种杰出学术期刊”称号。
2013年，获中国科学技术信息研究所“中国科技论文统计源期刊”（包括1930种中文期刊和64种英文期刊）评选出的2013年度“百种中国杰出学术期刊” 荣誉称号。