2002年，吉尔吉斯国际大学（IUK）签署了《博洛尼亚宣言》加入博洛尼亚进程，也是中亚地区首家加入该进程的大学。2003年，IUK转变为教育、科学和工业综合性大学，开始实施欧洲学分互认体系（ECTS），同年成立了吉尔吉斯国际大学国际高等医学院。2007年起，学校开始为吉尔吉斯共和国主要文凭颁发欧洲“文凭补充文件”。
学校强调国际化教育，致力于培养具有国际视野和跨文化交流能力的人才。学校积极参与国际合作与交流项目，与多国高等教育机构建立了合作关系。例如，与中国的西安科技大学高新学院签署了国际化交流与合作项目，旨在推动语言文化交流、人才培养和学术交流等领域的合作。学校提供多种形式的海外学习和实践机会，如孔子学院项目、交换生项目、校级交流项目以及留学生项目等。这些项目不仅增进了学生的国际经验，也促进了教师之间的学术交流和合作。