科研平台
截至2021年11月，学校设有40多个科研机构以及150多个科研和教学实验室，其中国家级重点实验室2个，国家工程实验室1个，国家地方联合工程研究中心1个，中俄“一带一路”联合实验室1个，国家级国际科技合作基地1个，国家级国际联合研究中心2个，国家级学科创新引智基地6个，工业和信息化部重点实验室13个，重点学科实验室2个，教育部重点实验室及工程研究中心6个，国家级创新创业示范基地1个，国家工程专业学位研究生联合培养示范基地2个，教育部国别和区域研究中心1个。学校设有国家大学科技园，获评“国家级科技企业孵化器”。
馆藏资源
截至2021年底，图书馆图书总量746.38万册，其中印刷型图书273.65万册。订购SCI、EI、Elsevier、Springer、Wiley、IEL、CNKI等中外文数据库125个，中外文全文电子期刊8.67万种，中外文电子图书472.73万册，中外文电子版学位论文1299.6万余篇。
学术期刊
《哈尔滨工程大学学报》
以“三海一核”
（船舶工业、海军装备、海洋开发、核能应用）为特色，同时刊登动力与能源、控制、通信、机电、计算机、材料与化学等领域的学术论文，反映学科前沿的最新科技研究成果。学报曾获工业与信息化部“优秀科技期刊奖”、黑龙江省政府“优秀期刊奖”，以及教育部“中国高校精品科技期刊奖”、“中国高校优秀科技期刊奖”等多项荣誉；是中文核心期刊、中国科技核心期刊，并被中国科学引文数据库（CSCD）、美国《工程索引》（Ei
Compendex）、荷兰Scopus数据库等数据库收录。
《Journal of Marine Science and Application》〔《船舶与海洋工程学报（英文版）》〕
被Pж（AJ）文摘杂志（俄）、CSCD中国科学引文数据库等收录。
《智能系统学报》
主要刊登神经网络与神经计算、智能信息处理、自然语言理解、智能系统工程、机器翻译、复杂系统、机器学习、知识工程与分布式智能、机器人、智能制造、粗糙集与软计算、免疫系统、机器感知与虚拟现实、智能控制与智能管理、可拓工程、人工智能基础等内容，为美国《剑桥科学文摘》、英国《科学文摘》、中文核心期刊、中国科学引文数据库（CSCD）来源期刊、中国科技核心期刊等数据库收录，曾获得中国高校百佳科技期刊、中国科技论文在线优秀期刊一等奖、中国高校特色科技期刊、工业和信息化部优秀期刊等多项荣誉。
《应用科技》
主要刊发各学科领域在应用研究方面高水平、实用性强的科技论文，主要辟有船舶与海洋工程、现代电子技术、计算机技术与应用、自动化技术、机电工程、材料与化学、核科学与技术等栏目。该刊是中国科技核心期刊，并已被美国剑桥科学文摘（CSA）、中国学术期刊综合评价数据库（CAJCED）、中国期刊全文数据库（CJFD）、万方数据、中文科技期刊数据库（CSTJ）等数据库收录。