科研机构
截至2024年4月，学校有博士后科研工作站2个、省部级重点实验室4个、省级工程技术研究中心3个、共建省级协同创新中心1个、校企共建省级新型研发机构1个、省级非物质文化遗产研究基地1个、省高校工程中心3个。
科研成果
2009年-2018年，学院有多个项目获得国家级和省部级立项。其中：2009年，学院有1个项目获评为教育部人文社会科学研究项目；立项省级科研项目8个。2011年，学院有1个项目获评为教育部人文社会科学研究项目；有5个项目获哈尔滨市科技进步奖。2013年，学院有2个项目获国家自然科学基金项目立项 ；有75个项目获省级科研项目立项；有5个项目获省级科学技术奖；有7个项目获省级社会科学优秀成果奖。2014年，学校有1个项目获国家社科基金青年项目立项；有1个项目获国家自然科学基金理论应急管理项目立项；有4个项目获省级科学技术奖；有69个项目获省级科研项目立项。2015年，学校有1个项目获国家社会科学基金项目立项。2017年，学校有2个项目获国家自然科学基金项目立项。2018年，学校有5个项目获国家自然科学基金项目立项；1个项目获国家社科基金项目立项；18个项目获省级社会科学优秀成果奖。
馆藏资源
截至2024年4月，学校图书馆藏书110余万册。截止到2020年12月，图书馆拥有电子图书169万余册。订购中文纸质期刊373种、外文纸质期刊25种，中文报纸36种。购有CNKI、维普、万方、读秀、超星等36个数据库、自建6个数据库。
学术期刊
《黑龙江工程学院学报》
《黑龙江工程学院学报》是由黑龙江工程学院主办的综合性学术期刊。主要发表土木与建筑、测绘、交通运输、机械、经济与管理、计算机、电气信息与自动化、仪器仪表、材料、艺术、语言文学、数学、社会工作、思想政治工作以及高等教育研究与管理等相关基础理论研究和应用研究方面的学术论文。本刊为双月刊，大16开本，国内外公开发行，已被美国《化学文摘》（CA）、日本科学技术振兴机构数据库（JST）以及中国学术期刊综合评价数据库等收录。
《测绘工程》
《测绘工程》是黑龙江工程学院和中国测绘学会主办的中国内外公开发行的测绘科技双月刊。设有学术研究、技术交流、测绘教育、测绘人物普等栏目。现为中国科技核心期刊；中国科学引文数据库来源期刊（CSCD）； 科学引文数据库来源期刊（SCD）;中国学术期刊综合评价数据库来源期刊；中国核心期刊（遴选）数据库收录期刊；中国学术期刊（光盘版）全文收录期刊;日本科学技术振兴机构数据库（JST）收录期刊；2021年入选最新发布的《科技期刊世界影响力指数（WJCI）报告》。
《交通科技与经济》
《交通科技与经济》是由黑龙江省教育厅主管、黑龙江工程学院主办的交通类学术期刊，1999年创刊，为双月刊。2022年《交通科技与经济》被评为“公路运输领域高质量科技期刊（T2）”；2017年、2020年连续两届被评为“RCCSE中国核心学术期刊(A)”；2018年成为日本科学技术振兴机构数据库（JST）收录期刊。2021年对栏目设置进行优化调整，主要设置交通运输规划与管理、道路与桥梁工程、载运工具、轨道交通、交通经济等栏目。